Adapter facture.net à mon activité

J'utilise facture.net car je trouve l'outil simple et intuitif.

Seul hic, il n'est pas totalement adapté à mon activité ce qui m'oblige à des doubles fonctions (à titre d'exemple: utilisé mes fichiers EXCEL pour le calcul du transport selon plusieurs paramètres poids, nombre de palette et département de livraison).

J'ai une activité de mandataire, je ne génère donc pas des devis mais des propositions commerciales.
Non plus des bons de commande mais des contrats de mandataire avec l'insertion des différents RIB de mes partenaires.

J'ai besoin d'un échange avec mes fournisseurs pour tarifé les produits.
J'ai besoin d'un fichier client particulier et professionnel.
J'ai besoin d'un onglet fournisseur pour la relation commerciale.
J'ai besoin d'un fichier produit (environ 5000 REF évolutives)
J'ai besoin d'un fichier transporteur ( incluant les grilles de transports et les différents modes de calcul)

Autre point j'aimerai que l'outil soit totalement indépendant de mon site WEB.

Dernier point il me faut une solution full-web évidemment mais avec la maintenance de l'outil, mise à jour...
Que je soit totalement serein pour exercer au mieux mon activité.

Voilà un dégrossi du projet.