FAIRE UNE MISE A JOUR

Je dois mettre à jour mon site qui est écrit en php et javascript. (J'ai la mise à jour) J'ai fait coder 2 modifications que je souhaite garder mais qui seront écrasées par la nouvelle version. L'objectif est de retrouver les 2 modifications dans les fichiers, de les sauvegarder, de faire la mise à jour puis de remettre les deux modifications en place. Ce n'est pas wordpress, et ce n'est pas la mise à jour de la version php7, mais la mise à jour de ma plateforme. Si c'est possible pour vous, merci pour votre réponse.