Le but du projet est de construire un programme qui construit et affiche un
arbre phylogénétique à partir de séquences nucléiques ou protéiques contenues
dans un fichier au format Multi-Fasta . Nous utiliserons la librairie Parallel
Java qui génère des arbres phylogénétiques à partir de séquences nucléiques au
format Phylip-Interleaved . L’application sera découpée en deux parties indépendantes qui seront développées l’une après l’autre. Dans la première, vous
devrez transformer un fichier Multi-Fasta au format Phylip-Interleaved . Puis,
vous devrez lire le fichier Phylip-Interleaved contenant les séquences, extraire les
séquences et calculer la matrice des distance entre ces séquences.
La deuxième partie consistera à construire un arbre phylogènétique à partir
de la matrice précédemment calculée et visualiser cette arbre.
Pour les plus téméraires, des exercices supplémentaires sont proposés. Ces
exercices vont vous permettre de rendre votre application plus ”modulaire” et
plus ”complete”. De plus, Ces exercices vous permettrons de développer une
application ”complexe” du point de vue de la programmation obje

Budget indicatif Moins de 500 €
Publié le 19 mars 2019 à 23h10
Début du projet Tout de suite
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Offres pour ce projet :

Offre déposée le 17/04/2019 à 01h31
Offre déposée le 26/03/2019 à 13h49
Offre déposée le 20/03/2019 à 10h26
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