Magento probleme reindexation plante le site

Bonjour ,
Depuis quelques jours nous avons un gros soucis sur notre magento qui entraine des lenteurs au niveau du frontend "site tres tres long a s'afficher ".
Les réindexation ne marche pas correctement et des grosses requetes sql (" non réalisable") prennent beaucoup de ressource serveur et entraine un plantage du site en frontend.

Exemple de requete n'arrivant pas a s'executer :
DELETE FROM `catalog_product_index_eav`
ou
SELECT "sur tous les produits."

notre site comprend +/- 40 000 produits sur 6 shops