Facturation (Numéro de série)

Bonjour,
A l'heure d'aujourd'hui, nous utilisons 2 modes de facturations :
-Free devis Factures (Boutique physique)
-Prestashop (Boutique en ligne).
Cependant il n'est pas possible de fonctionner avec deux systèmes différents car :
-Impossible que les numéros de suivis se suivent.
-Notre stock ne peut pas suivre.
-problématique au niveau comptable

Ma question est la suivante :
Existe-t-il un moyen de concilier avec une application prestashop notre boutique physique en ligne et physique ?
Ps : Nous devons inscrire des numéros de série sur des produits et il n'est pas possible de les inscrire sur prestashop.